Imponerende og strålende langt utover landskapet ligger klosteret på et fjell over Donau. Det ble grunnlagt i 1089 av Babenberg-hertugene og befolket av benediktinermunker. Også denne klosterorden ble rammet av de kirkelige misforholdene i det 13.århundre. På konsilet i Konstanz ble besluttet en reform som skulle starte her og som senere ble kjent som Melker kloster-reform. Klosteret overlevde reformasjonen, om en svekket, og ble til motreformasjonens senter hvor klosterskolen ble nyorganisert etter jesuittenes forbilde.
I det 18.århundre hadde klosteret kommet seg igjen økonomisk slik at klosterhistoriens største prosjekt kunne finne sted: den fullstendige gjenreisningen av komplekset i barokkstil som tok 45 år.
I dag er klosteret Melk på UNESCO-verdensarvlisten og et kultursenter av høyeste rang som tiltrekker mange besøkere. Det er også et levende benediktinerkloster med en velkjent klosterskole.